Молодые исследователи решали реальные научные и клинические задачи в ходе школы «Анализ единичных клеток» на базе Томского НИМЦ

Участниками VII Международной научно-практической школы «Анализ единичных клеток», которая проходила в Томске с 27 по 29 мая, стали более 40 молодых ученых из России и Беларуси.

Под руководством экспертов в сфере омиксных технологий и биоинформатики они смогли не только познакомиться с современными подходами к анализу единичных клеток, но и применить их на практике в реальных биомедицинских проектах.

Насыщенная программа школы включила обмен опытом в формате открытой дискуссии: преподаватели и участники обсудили результаты своих исследовательских проектов и текущие проблемы, а также обозначили перспективные направления развития в области анализа единичных клеток.

— В ходе моего практикума на примере реальных датасетов рака яичников высокой степени злокачественности участники анализировали лиганд-рецепторные взаимодействия между единичными клетками и характеризовали пространственный транскриптомный профиль опухолевого микроокружения, - рассказал Павел Ямщиков, руководитель Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ, руководитель практикума по продвинутой биоинформатике.

— Мы работали на реальном биологическом образце — и это позволило не просто проговорить протокол, а показать всю последовательность этапов: от формирования микрокапель до получения готовой библиотеки. Результат, который участники увидели своими глазами, оказался отличным. Благодаря наглядной демонстрации коллеги смогли разобраться в ключевых принципах метода, понять, на какие этапы нужно обращать особое внимание и где следует быть максимально аккуратными. Уверен, полученный опыт поможет им в дальнейшем самостоятельно применять этот подход в своих исследованиях, - поделился Антон Федоров, канд. мед. наук, научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ, руководитель практики по транскриптомике единичных клеток.

— У нас прошла двухдневная практика по Stereo-seq — это одна из современных, но при этом не самых простых технологий пространственной транскриптомики. Мы прошли протокол практики от и до. Было много вопросов и обсуждений, что дополнительно помогало пониманию методики. В итоге у нас получилась качественная библиотека, полностью готовая к секвенированию. Самое главное, участники увидели весь процесс своими глазами и отработали ключевые этапы, что поможет им проще осваивать и другие серьезные молекулярные методы, - рассказала Елизавета Простакишина, младший научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ, руководитель практики по пространственной транскриптомике.

Впечатлениями поделилась Анастасия Куркач, участница научно-практической школы, которая приехала в Томск из Беларуси. Анастасия работает в Государственном комитете судебных экспертиз РБ, и школа стала для нее возможностью получить представление о современных молекулярно-генетических методах.

— Персонализированный подход важен в судебно-экспертной деятельности, в том числе и в судебной биохимии. Исследование протеома и постмортальной деградации белков является перспективным направлением. Во время учёбы я проходила практику в ОДО Праймтех, где участвовала в реализации проектов компании, работала в молекулярно-биологической лаборатории. Школа для меня - шикарная возможность получить знания и реальное представление о современных молекулярно-генетических методах. Было много новой информации, которую я буду уже самостоятельно обрабатывать и адаптировать под свои потребности, - рассказала Анастасия.

• Международные научно-практические школы «Анализ единичных клеток» проводятся с 2019 года и традиционно собирают ведущих ученых России и зарубежья, специалистов в области молекулярной и клеточной биологии и биоинформатики. За семь лет школа сформировала профессиональное сообщество, Ассоциацию анализа единичных клеток, объединившую уже более 500 человек из 50 стран.

Организаторы: Томский НИМЦ, РУДН, Ассоциация анализа отдельных клеток (ASCA)

Партнеры: компании Helicon, MGI, Химмед, SeekGene, Sesana, Диаэм, Аламед.