Биоинформатика
Студсовет ФБМФ·26 Sep 2018
Лаборатория геномной инженерии
Лаборатория находится на Физтехе (БК).
В лаборатории занимаются молекулярной биологией и биоинформатикой.
Отзыв студента №1
За время работы в лаборатории были освоены все основные методы клонирования: рестрикция, лигирование, полимеразная цепная реакция, форез; а также клеточная работа.
И общая обстановка в лаборатории, и взаимодействие с научным руководителем заслуживают очень высокой оценки. Как правило, студентам в лаборатории платят.
Лаборатория для тех, кто готов очень много работать. Коллектив молодой и очень дружный, все помогут, всему научат, но самостоятельно нужно проделывать большую работу. Каждую неделю есть лабмитинги, где отчитываемся по работе и джорнал клабы, где разбираем новые статьи.
Отзыв студента №2
За время работы в лаборатории были освоены запуск вычислений на кластере, Pymol, анализ данных с помощью Python. В основном работала с программами, которые выполняют узкую задачу, которой я занималась. Базовые биоинформатические навыки: поискать что-то бластом, посчитать p-value.
Общая обстановка в лаборатории и взаимодействие с научным руководителем заслуживают средней оценки. Как правило, студентам в лаборатории платят, если много работать.
Есть возможность заниматься как молекулярной биологией в мокрой лабе, так и биоинформатикой. Еще у нас были очень полезные семинары по биоинформатике и journal club.
Отзыв студента №3
За время работы в лаборатории были освоены молекулярное клонирование, работа с эукариотическими и прокариотическими клетками.
Общая обстановка в лаборатории заслуживает высокой оценки, а взаимодействие с научным руководителем — низкой. Как правило, студентам в лаборатории не платят.
Атмосфера в лаборатории дружелюбная, но нужно много работать, периодически отчитываться.
Лаборатория ионной и молекулярной физики
Лаборатория находится на Физтехе (БК).
В лаборатории занимаются спектроскопией, биоинформатикой, анализом данных в биологии.
Отзыв студента №1
Название бакалаврской работы такое: “Классификация тканей головного мозга по их масс-спектрам с помощью методов машинного обучения”.
И общая обстановка в лаборатории, и взаимодействие с научным руководителем заслуживают высокой оценки. Как правило, в лаборатории платят, если хорошо работаешь.
В лаборатории можно заниматься и экспериментом (куча видов разной масс-спектрометрии), и анализом полученных данных (Python и машинное обучение). И тому, и тому могут научить, главное, чтобы было желание.
Отзыв студента №2
За время работы в лаборатории были освоены работа с git, rule-based моделирование, скрипты на R.
И общая обстановка в лаборатории, и взаимодействие с научным руководителем заслуживают низкой оценки. Как правило, студентам за работу в лаборатории платят.
Лаборатория занимается масс-спектрометрией (причём с инженерной точки зрения тоже), но мой руководитель предложил проект по системной биологии липидов, потому что эта тема была для меня более интересной. Поэтому название лаборатории не полностью отражает возможные проекты.
Европейская Лаборатория Молекулярной Биологии
Лаборатория располагается в Риме.
В лаборатории занимаются биоинформатикой, single-cell RNA-seq, программированием на R, mouse biology.
Отзыв студента
За время работы были получены основные навыки по работе с пакетами в R для single-cell RNA-seq и bulk RNA-seq, в т.ч. разработан свой пакет, улучшены письменный и разговорный английский (и итальянский), освоены базовые техники работы с клеточной культурой.
И общая обстановка в лаборатории, и взаимодействие с научным руководителем заслуживают очень высокой оценки. Студентам в лаборатории платят.
Лаборатория системной биологии
Находится в ИОГен РАН (м. Ленинский проспект/Площадь Гагарина).
В лаборатории занимаются биоинформатикой.
Отзыв студента №1
За время работы были освоены навыки работы со всеми необходимыми инструментами (ML), обработка Single cell данных.
Общая обстановка в лаборатории благоприятная, а взаимодействие с научным руководителем заслуживает средней оценки.
Как правило, студентам в лаборатории не платят.
Работать можно удаленно. Семинары примерно раз в месяц, но в любой момент можно задать вопрос научному руководителю и получить развернутый ответ.
Отзыв студента №2
За время работы были получены основные навыки работы с большими данными, оптимизирования для них кода.
Как правило, студентам в лаборатории не платят.
Лаборатория сравнительной генетики животных
Находится в ИОГен РАН (м. Ленинский проспект/Площадь Гагарина).
В лаборатории занимаются биоинформатикой.
Отзыв студента
Общая обстановка в лаборатории и взаимодействие с научным руководителем заслуживают низкой оценки.
Как правило, студентам в лаборатории не платят.
Лаборатория Геномной Географии
Лаборатория находится в ИОГен РАН (м. Ленинский проспект/Площадь Гагарина).
В лаборатории занимаются биоинформатикой.
Отзыв студента
За время работы в лаборатории были освоены анализ геномных последовательностей, программирование на Python (новые методы), филогенетический анализ.
Общая обстановка в лаборатории и взаимодействие с научным руководителем заслуживают средней оценки.
Как правило, студентам в лаборатории не платят.
Стоит идти, если хочется сравнительно расслабленно попрогать. Сначала обсудил пару идей с завлабом, потом был перенаправлен на научного руководителя.
Научный руководитель достаточно хорошо обрисовал задачу, решение (как что прогать) нужно было искать самому. Также в конце он хорошо помог с текстом и частью обработки на своём софте. Мои же скрипты помогли ему в его собственной работе.
В работе требуется много инициативы, пинать совсем не будут, скорее надо иногда про себя напоминать. Дедлайнов мне почти не ставили. Если ничего не делать, то про тебя забудут и работу никакую в итоге не сделаешь.
В лабу ездил раз 5-6 за год, 95% общения с научным руководителем по емейлу. Удобно, но может расслабить.
Лаборатория молекулярных механизмов биологической адаптации
Лаборатория находится в ИМБ РАН (м. Ленинский проспект/Площадь Гагарина).
В лаборатории занимаются молекулярной биологией и биоинформатикой.
Отзыв студента
За время работы в лаборатории были освоены двумерный гель-электрофорез и вестерн блот. Кроме того, освоены биоинформатические методы: алгоритм BLAST, работа с NGS, анализ дифф. экспресии генов по данным RNAseq, GSEA, анализ сплайс-изоформ и событий альтернативного сплайсинга, сборка геномов (как гибридная, так и из nanopore-ридов), аннотация геномов и проверка качества аннотации и сборки генома. Освоены основные навыки работы в linux, R language.
И общая обстановка в лаборатории, и взаимодействие с научным руководителем заслуживают очень высокой оценки.
Есть возможность получать деньги за работу в лаборатории.
Лаба - топ. Прекрасный коллектив. Отличное начальство, отношения между всеми очень теплые. Гранты есть. Работы хватает за глаза. Минус - далеко от физтеха (Вавилова 32). Что еще надо?